Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DENND5BQ6ZUT9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DENND5BQ6ZUT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DENND5BQ6ZUT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DENND5BQ6ZUT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms