Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SRCAPQ6ZRS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRCAPQ6ZRS2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRCAPQ6ZRS2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SRCAPQ6ZRS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SRCAPQ6ZRS2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms