Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CASC2Q6XLA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CASC2Q6XLA1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms