Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00575Q6W349 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00575Q6W349 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms