Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS1Q6VY07 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PACS1Q6VY07 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PACS1Q6VY07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PACS1Q6VY07 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PACS1Q6VY07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PACS1Q6VY07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms