Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP12Q6UXS9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP12Q6UXS9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP12Q6UXS9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms