Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN4Q6PJG9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRFN4Q6PJG9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRFN4Q6PJG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRFN4Q6PJG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms