Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG6

BRAT1, BRCA1-associated ATM activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAT1Q6PJG6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRAT1Q6PJG6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRAT1Q6PJG6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRAT1Q6PJG6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRAT1Q6PJG6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRAT1Q6PJG6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms