Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEPROQ6NW34 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEPROQ6NW34 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEPROQ6NW34 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms