Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RWDD4Q6NW29 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RWDD4Q6NW29 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RWDD4Q6NW29 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RWDD4Q6NW29 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RWDD4Q6NW29 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms