Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGB2Q6NT52 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CGB2Q6NT52 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CGB2Q6NT52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CGB2Q6NT52 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms