Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF6Q6KF10 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GDF6Q6KF10 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF6Q6KF10 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF6Q6KF10 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms