Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RALGAPA1Q6GYQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms