Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms