Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A4Q6AI14 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A4Q6AI14 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC9A4Q6AI14 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC9A4Q6AI14 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms