Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LARP1BQ659C4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LARP1BQ659C4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LARP1BQ659C4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms