Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
GGNBP1Q5YKI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GGNBP1Q5YKI7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GGNBP1Q5YKI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms