Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SHEQ5VZ18 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms