Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPATA1Q5VX52 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SPATA1Q5VX52 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA1Q5VX52 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA1Q5VX52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA1Q5VX52 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms