Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYDE2Q5VT97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYDE2Q5VT97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYDE2Q5VT97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYDE2Q5VT97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYDE2Q5VT97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYDE2Q5VT97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYDE2Q5VT97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYDE2Q5VT97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms