Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT6Q5T7P8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT6Q5T7P8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT6Q5T7P8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT6Q5T7P8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT6Q5T7P8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT6Q5T7P8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT6Q5T7P8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT6Q5T7P8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms