Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SWT1Q5T5J6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SWT1Q5T5J6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SWT1Q5T5J6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SWT1Q5T5J6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms