Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T1

TMEM170B, Transmembrane protein 170B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM170BQ5T4T1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM170BQ5T4T1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM170BQ5T4T1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM170BQ5T4T1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM170BQ5T4T1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM170BQ5T4T1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM170BQ5T4T1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM170BQ5T4T1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms