Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIRPB2Q5JXA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIRPB2Q5JXA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIRPB2Q5JXA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms