Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIN4Q56A73 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPIN4Q56A73 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPIN4Q56A73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms