Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGO2Q562F6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SGO2Q562F6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SGO2Q562F6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SGO2Q562F6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms