Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHLDA2Q53GA4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PHLDA2Q53GA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHLDA2Q53GA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHLDA2Q53GA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms