Protein–RNA interactions for Protein: Q53FP2

TMEM35A, Transmembrane protein 35A, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35AQ53FP2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM35AQ53FP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM35AQ53FP2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35AQ53FP2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35AQ53FP2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms