Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FNDC1Q4ZHG4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FNDC1Q4ZHG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FNDC1Q4ZHG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FNDC1Q4ZHG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms