Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC36A3Q495N2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC36A3Q495N2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC36A3Q495N2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC36A3Q495N2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms