Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SP6Q3SY56 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SP6Q3SY56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SP6Q3SY56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms