Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
KRTAP21-1Q3LI58 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms