Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANKRD55Q3KP44 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms