Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3C1V9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3C1V9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Q3C1V9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3C1V9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Q3C1V9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3C1V9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Q3C1V9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3C1V9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Q3C1V9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3C1V9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Q3C1V9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3C1V9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q3C1V9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3C1V9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3C1V9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3C1V9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3C1V9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q3C1V9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3C1V9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3C1V9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3C1V9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q3C1V9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q3C1V9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3C1V9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3C1V9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3C1V9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Q3C1V9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3C1V9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3C1V9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3C1V9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q3C1V9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3C1V9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3C1V9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q3C1V9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q3C1V9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Q3C1V9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3C1V9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3C1V9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3C1V9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3C1V9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Q3C1V9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3C1V9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3C1V9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3C1V9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Q3C1V9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q3C1V9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3C1V9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3C1V9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3C1V9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q3C1V9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q3C1V9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q3C1V9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Q3C1V9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Q3C1V9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3C1V9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3C1V9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3C1V9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q3C1V9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3C1V9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q3C1V9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q3C1V9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Q3C1V9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms