Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NBPF1Q3BBV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NBPF1Q3BBV0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NBPF1Q3BBV0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NBPF1Q3BBV0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NBPF1Q3BBV0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms