Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX4Q33E94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFX4Q33E94 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFX4Q33E94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms