Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-BQ31612 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-BQ31612 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-BQ31612 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms