Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q1T7F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q1T7F1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q1T7F1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q1T7F1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q1T7F1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q1T7F1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q1T7F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q1T7F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q1T7F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q1T7F1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q1T7F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q1T7F1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q1T7F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q1T7F1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q1T7F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q1T7F1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q1T7F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q1T7F1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q1T7F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q1T7F1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q1T7F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q1T7F1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q1T7F1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q1T7F1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q1T7F1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q1T7F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms