Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMA3Q16787 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LAMA3Q16787 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LAMA3Q16787 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LAMA3Q16787 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
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