Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGCAQ16586 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGCAQ16586 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SGCAQ16586 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SGCAQ16586 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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