Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC18A3Q16572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC18A3Q16572 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC18A3Q16572 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC18A3Q16572 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms