Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CARTPTQ16568 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CARTPTQ16568 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CARTPTQ16568 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms