Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MRPL23Q16540 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MRPL23Q16540 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MRPL23Q16540 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms