Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
DDB1Q16531 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
DDB1Q16531 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDB1Q16531 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
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DDB1Q16531 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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DDB1Q16531 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDB1Q16531 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDB1Q16531 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
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