Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SSX1Q16384 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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SSX1Q16384 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSX1Q16384 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSX1Q16384 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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