Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDCD2Q16342 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDCD2Q16342 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDCD2Q16342 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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