Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMAD1Q15797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD1Q15797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD1Q15797 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD1Q15797 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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