Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRADDQ15628 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRADDQ15628 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRADDQ15628 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRADDQ15628 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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