Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC23AQ15436 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEC23AQ15436 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEC23AQ15436 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SEC23AQ15436 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEC23AQ15436 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms