Protein–RNA interactions for Protein: Q15369

ELOC, Elongin-C, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOCQ15369 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELOCQ15369 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ELOCQ15369 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELOCQ15369 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELOCQ15369 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms