Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF4Q15306 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF4Q15306 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IRF4Q15306 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF4Q15306 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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